Varian Virus di Brazil Banyak Terinfeksi Yang Sudah Sembuh Dari Covid-19

Hanya dalam hitungan minggu, dua varian virus corona menjadi begitu akrab sehingga Anda dapat mendengar nama alfanumeriknya yang tidak dapat dipahami secara teratur. diucapkan di berita televisi.

B.1.1.7, pertama kali diidentifikasi di Inggris, telah menunjukkan kekuatan untuk menyebar jauh dan cepat. Di Afrika Selatan, mutan yang disebut B.1.351 dapat menghindari antibodi manusia, menumpulkan keefektifan beberapa vaksin.

Para ilmuwan juga mengamati varian ketiga terkait yang muncul di Brasil, yang disebut P.1. Penelitian telah lebih lambat pada P.1 sejak penemuannya pada akhir Desember, membuat para ilmuwan tidak yakin seberapa banyak yang perlu dikhawatirkan.

“Saya menahan napas,” kata Bronwyn MacInnis, seorang ahli epidemiologi di Broad Institute.

Sekarang tiga studi menawarkan sejarah yang menenangkan dari kenaikan meteorik P.1 di kota Manaus di Amazon. Kemungkinan besar muncul di sana pada bulan November dan kemudian memicu lonjakan kasus virus korona yang memecahkan rekor. Itu mendominasi kota sebagian karena penularan yang meningkat, penelitian menemukan.

Tetapi itu juga memperoleh kemampuan untuk menginfeksi beberapa orang yang memiliki kekebalan dari serangan Covid-19 sebelumnya. Dan percobaan laboratorium menunjukkan bahwa P.1 dapat melemahkan efek perlindungan dari vaksin China yang sekarang digunakan di Brasil.

Studi baru belum dipublikasikan di jurnal ilmiah. Penulis mereka memperingatkan bahwa temuan pada sel di laboratorium tidak selalu diterjemahkan ke dunia nyata, dan mereka baru mulai memahami perilaku P.1.

“Penemuan ini berlaku untuk Manaus, tapi saya tidak tahu apakah itu berlaku untuk tempat lain,” kata Nuno Faria, seorang ahli virus di Imperial College London yang membantu memimpin banyak penelitian baru.

Tetapi bahkan dengan misteri yang tersisa di sekitar P.1, para ahli mengatakan itu adalah varian yang harus ditanggapi dengan serius. “Adalah benar untuk khawatir tentang P.1, dan data ini memberi kami alasannya,” kata William Hanage, seorang ahli epidemiologi di Sekolah Kesehatan Masyarakat Harvard TH Chan.

P.1 sekarang menyebar ke seluruh Brasil dan telah ditemukan di 24 negara lain. Di Amerika Serikat, Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit telah mencatat enam kasus di lima negara bagian: Alaska, Florida, Maryland, Minnesota dan Oklahoma.

Untuk mengurangi risiko wabah P.1 dan infeksi ulang, Dr. Faria mengatakan penting untuk menggandakan setiap tindakan yang kita miliki untuk memperlambat penyebaran virus corona. Masker dan jarak sosial dapat bekerja melawan P.1. Dan vaksinasi dapat membantu menurunkan penularannya dan melindungi mereka yang terinfeksi dari penyakit parah.

“Pesan utamanya adalah Anda perlu meningkatkan semua upaya vaksinasi secepat mungkin,” katanya. “Anda harus selangkah lebih maju dari virus.”

Faria dan rekan-rekannya mulai melacak virus corona ketika meledak di Brasil musim semi lalu. Manaus, kota berpenduduk dua juta di Amazon Brasil, tadinya memukul sangat keras. Pada puncak musim semi, kuburan Manaus dipenuhi oleh mayat-mayat.

Tetapi setelah mencapai puncaknya pada akhir April, Manaus tampaknya telah melewati pandemi terburuk. Beberapa ilmuwan mengira bahwa penurunan berarti Manaus telah memperoleh kekebalan kawanan.

Faria dan koleganya mencari antibodi virus corona dalam sampel dari bank darah Manaus pada bulan Juni dan Oktober. Mereka menentukan itu kira-kira tiga perempat penduduk Manaus telah terinfeksi.

Namun menjelang akhir tahun 2020, kasus baru mulai melonjak lagi. “Kasus sebenarnya jauh lebih banyak dibandingkan puncak kasus sebelumnya, yang terjadi pada akhir April,” kata Dr. Faria. Dan itu sangat membingungkan kami.

Untuk mencari varian, Dr. Faria dan rekannya memulai upaya pengurutan genom baru di kota tersebut. Meskipun B.1.1.7 telah tiba di bagian lain Brasil, mereka tidak menemukannya di Manaus. Sebaliknya, mereka menemukan varian yang belum pernah dilihat orang sebelumnya.

Banyak varian dalam sampel mereka berbagi 21 mutasi yang tidak terlihat pada virus lain yang beredar di Brasil. Dr. Faria mengirim pesan teks ke seorang kolega: “Saya rasa saya melihat sesuatu yang sangat aneh, dan saya cukup khawatir tentang ini.”

Beberapa mutasi khususnya membuatnya khawatir, karena para ilmuwan telah menemukannya di B.1.1.7 atau B.1.351. Eksperimen menunjukkan bahwa beberapa mutasi mungkin membuat varian lebih mampu menginfeksi sel. Mutasi lain memungkinkan mereka menghindari antibodi dari infeksi sebelumnya atau yang dihasilkan oleh vaksin.

Saat Dr. Faria dan koleganya menganalisis hasil mereka, para peneliti di Jepang pun menganalisisnya membuat penemuan serupa. Empat turis yang pulang dari perjalanan ke Amazon pada 4 Januari dinyatakan positif mengidap virus corona. Pengurutan genom mengungkapkan serangkaian mutasi yang sama yang dilihat Dr. Faria dan rekan-rekannya di Brasil.

Faria dan rekan-rekannya memposting deskripsi P.1 pada forum virologi online pada 12 Januari. Mereka kemudian menyelidiki mengapa P.1 begitu umum. Mutasi mungkin membuatnya lebih menular, atau mungkin beruntung. Secara kebetulan, varian tersebut mungkin muncul di Manaus tepat saat kota menjadi lebih santai tentang tindakan kesehatan masyarakat.

Mungkin juga P.1 menjadi umum karena dapat menginfeksi kembali orang. Biasanya, infeksi ulang virus korona jarang terjadi, karena antibodi yang diproduksi oleh tubuh setelah infeksi kuat selama berbulan-bulan. Tapi ada kemungkinan bahwa P.1 membawa mutasi yang mempersulit antibodi tersebut untuk menempel padanya, memungkinkannya untuk menyelinap ke dalam sel dan menyebabkan infeksi baru.

Para peneliti menguji kemungkinan ini dengan melacak P.1 dari sampel paling awal pada bulan Desember. Pada awal Januari, itu membuat 87 persen sampel. Pada bulan Februari, semua itu telah diambil alih sepenuhnya.

Menggabungkan data dari genom, antibodi, dan catatan medis di Manaus, para peneliti menyimpulkan bahwa P.1 menaklukkan kota itu bukan berkat keberuntungan tetapi karena biologi: mutasinya membantunya menyebar. Seperti B.1.1.7, rata-rata dapat menginfeksi lebih banyak orang daripada varian lain. Mereka memperkirakan itu di suatu tempat antara 1,4 dan 2,2 kali lebih mudah ditularkan daripada garis keturunan lain dari virus korona.

Tapi itu juga mendapat keuntungan dari mutasi yang memungkinkannya lolos dari antibodi dari virus korona lain. Mereka memperkirakan bahwa dari 100 orang yang terinfeksi di Manaus tahun lalu, antara 25 dan 61 di antaranya mungkin telah terinfeksi ulang oleh P.1.

Para peneliti menemukan dukungan untuk kesimpulan ini di sebuah eksperimen di mana mereka mencampurkan virus P.1 dengan antibodi dari Brasil yang menderita Covid-19 tahun lalu. Mereka menemukan bahwa efektivitas antibodi mereka turun enam kali lipat terhadap P.1 dibandingkan dengan virus korona lainnya. Penurunan tersebut mungkin berarti bahwa setidaknya beberapa orang akan rentan terhadap infeksi baru dari P.1.

“Tampaknya semakin banyak bukti yang menunjukkan bahwa sebagian besar kasus yang terkait dengan gelombang kedua memang semacam infeksi ulang,” kata Dr. Faria.

Dr. Faria dan peneliti lain sekarang mencari di seluruh Brasil untuk mengamati penyebaran P.1. Dr. Ester Sabino, seorang ahli penyakit menular di Fakultas Kedokteran Universitas São Paulo, mengatakan bahwa salah satu wabah baru muncul di Araraquara, sebuah kota di Brasil dengan 223.000 orang yang tidak memiliki tingkat Covid-19 yang tinggi sebelum P.1 tiba.

Jika orang di Araraquara tidak memiliki antibodi tingkat tinggi sebelum kedatangan P.1, katanya, itu menunjukkan bahwa varian tersebut mungkin dapat menyebar di tempat-tempat tanpa sejarah ekstrim Manaus. “Ini mungkin terjadi di tempat lain,” katanya.

Michael Worobey, ahli virologi di University of Arizona yang tidak terlibat dalam penelitian tersebut, mengatakan sudah waktunya untuk memperhatikan P.1 di Amerika Serikat. Dia berharap ini akan menjadi lebih umum di Amerika Serikat, meskipun harus bersaing dengan B.1.1.7, yang mungkin segera menjadi varian utama di banyak negara.

“Paling tidak, itu akan menjadi salah satu pesaing,” kata Dr. Worobey.

Dalam percobaannya, Dr. Faria dan rekannya juga menguji antibodi dari delapan orang yang menerima CoronaVac, vaksin buatan China yang telah digunakan di Brazil. Mereka menemukan bahwa antibodi yang dihasilkan oleh vaksin kurang efektif dalam menghentikan varian P.1 dibandingkan jenis lainnya.

Dr. Faria mengingatkan bahwa hasil ini, yang berasal dari sel dalam tabung reaksi, tidak berarti bahwa vaksin akan kurang efektif dalam melindungi orang yang sebenarnya dari P.1. Vaksin mungkin memberikan perlindungan yang kuat dari P.1 bahkan jika antibodi yang dihasilkannya tidak sekuat itu. Dan bahkan jika varian berhasil menginfeksi orang yang divaksinasi, kemungkinan besar mereka akan tetap terlindung dari serangan Covid-19 yang parah.

Bagi Dr. Sabino, hal terpenting dari P.1 adalah ancaman yang ditimbulkan oleh varian ketika mereka dapat muncul di mana saja di dunia.

“Ini hanya masalah waktu dan kesempatan,” katanya.